结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤,我国最新统计显示我国结直肠癌发病人数为38.8万人,位居恶性肿瘤发病率第三位。随着EGFR、KRAS、NRAS等基因检测手段的发展,结直肠癌已经进入分子诊断和治疗的时代。结直肠癌的“精准医学”就是在癌症基因组测序和信息分析基础上,解析结直肠癌发生、发展、侵袭、转移和复发的机制,有针对性地实施个性化治疗。
l OmiScope TM Colorectal Cancer 16 Panel 基因检测(肠癌16基因)
肠癌16基因检测是关于CRC的小Panel 产品,其中包括了16个NCCN指南推荐的CRC靶向用药基因。以下是16个靶向用药基因列表。
ALK |
BRAF |
EGFR |
ERBB2 |
KIT |
KRAS |
TP53 |
NTRK3 |
MAP2K1 |
MET |
NRAS |
NTRK1 |
NTRK2 |
ROS1 |
PIK3CA |
RET |
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l OmiScope TM Lung Cancer 35 Panel 基因检测(肠癌35基因)
肠癌35基因检测是关于CRC的中Panel产品,其中包括了35个肺癌靶向用药基因和32个化疗药物基因。以下是35个靶向用药基因列表和23个化疗用药基因列表。
靶向用药基因列表
AKT1 |
ALK |
BRAF |
CCND1 |
CDK4 |
CDKN2A |
CTNNB1 |
DNMT3A |
EGFR |
ERBB2 |
FBXW7 |
FGFR3 |
GNAS |
HRAS |
IDH1 |
KIT |
KRAS |
MAP2K1 |
MET |
MLH1 |
MSH2 |
MSH6 |
NF1 |
NRAS |
NTRK1 |
NTRK2 |
NTRK3 |
PIK3CA |
PMS1 |
PMS2 |
PTEN |
RAF1 |
RET |
RHOA |
RIT1 |
ROS1 |
SMAD2 |
SMAD4 |
TP53 |
TSC2 |
U2AF1 |
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化疗用药基因列表
ABCB1 |
ACYP2 |
ATIC |
C8orf34 |
CYP19A1 |
DPYD |
XRCC1 |
DYNC2H1 |
ERCC1 |
GSTP1 |
MTHFR |
MTRR |
NQO1 |
XPC |
NR_103444 |
NT5C2 |
PNPLA3 |
SEMA3C |
TP53 |
SOD2 |
UMPS |
TYMS |
UGT1A1 |
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l 注:关于CRC的靶向用药基因
⑴ RAS
RAS基因是肠癌中比较关键的基因,RAS基因家族有三个成员:KRAS、NRAS和HRAS。结直肠癌中,KRAS突变频率约为40%,NRAS的突变频率约为4%。RAS基因主要调控RAF-MEK-ERK信号通路和PI3K-PDK1-PKB信号通路,均位于EGFR下游。KRAS突变主要实在12和13号外显子上,常见的突变有G12D、G12V和G13D。
KRAS和NRAS目前没有获批的靶向药物,但其激活突变,可用于对EGFR-TKI类药物疗效预判,是肿瘤靶向药物重要伴随诊断之一。研究表明具有KRAS和NRAS突变的患者对西妥昔单抗(Cetuximab)或帕尼单抗(Panitumumab)的治疗不敏感。
u NCCN指南建议,对所有转移性结直肠癌患者进行KRAS和NRAS突变检测,有突变的患者不宜采用EGFR靶向治疗。
u FDA批准帕尼单抗联合奥沙利铂的化学疗法用于治疗KRAS或NRAS野生型患者。
u 中国国家药品监督管理局(NMPA)已批准西妥昔单抗联合FOLFOX(奥沙利铂+亚叶酸钙+5-氟尿嘧啶[5-FU])或FOLFIRI(伊立替康+亚叶酸钙+5-FU)一线治疗RAS野生型转移性CRC患者、或联合伊立替康(Irinotecan)用于对伊立替康化疗无效的患者。
⑵ BRAF
BRAF基因属于RAF基因家族,该家族包括ARAF、BRAF和CRAF基因,主要参与RAF-MEK-ERK信号通路,调控细胞增殖。BRAF在CR患者中突变率为5-15%,在微卫星高度不稳定(MSI-H)肿瘤中突变率明显高于微卫星稳定(MSS)肿瘤。
BRAF V600E突变是CRC的预测标志和不良预后标志,该突变目前的药物有康奈非尼(Encorafenib)、达拉非尼、维莫非尼。2020年4月8日,FDA批准BRAF抑制剂康奈非尼联合EGFR单抗西妥昔单抗用于治疗既往治疗后进展且携带BRAF V600E突变的转移性结直肠癌成人患者。该方案是FDA批准的首个也是唯一一个专门用于既往接受过一种或两种前期疗法且携带 BRAF V600E 突变的mCRC成人患者的靶向双联治疗方案。
研究发现FOLFOXIRI+贝伐珠单抗可能成为BRAF突变患者的最佳治疗。BRAF V600突变检测,应与dMMR/MSI同时进行,用来进行预后分层,同时区分林奇综合征。
NCCN指南建议,对KRAS/NRAS野生型的结直肠癌IV患者选择BRAF检测。
⑶ HER2/ ERBB2
HER2在CRC中主要突变方式是HER2扩增,在2-6%的晚期或转移性结直肠癌患者中发现HER2扩增或过表达。
HER2基因扩增可能是转移性结直肠癌西妥昔治疗耐药的原因之一。研究表明,HER2扩增被看作可能是转移性CRC癌患者抗EGFR治疗疗效预测的负性标志物,甚至有望成为独立于RAS和BRAF V600E突变的另一个转移性结直肠癌独特的亚型。NCCN指南推荐存在HER2扩增且RAS基因为野生型的患者使用曲妥珠单抗联合帕妥珠单抗(Pertuzumab)/拉帕替尼(Lapatinib)。