奥明生物发布全球首款环状RNA IRES预测模型DeepCIP

近日,奥明生物以及浙江大学智能创新药物研究院发布了全球首款环状RNA IRES预测模型。该研究成果以《DeepCIP: a multimodal deep learning method for the prediction of internal ribosome entry sites of circRNAs》为标题发表在预印本平台bioRxiv上,并对其中的方法和运行程序分别进行了发明专利申请保护和软著保护申请。

近年来,随着mRNA新冠疫苗的成功获批,mRNA已跃居疾病预防和癌症治疗等领域药物研究的前沿。与线性mRNA相比,环状RNA具有更好的热稳定性、更长的有效时间和更特异的组织表达,被认为是开发下一代mRNA药物的理想平台目前环状RNA已成为核酸药物领域的研究热点。最近一年全球环状RNA领域融资规模达到近40亿元。

奥明基因及奥明生物的创始人童云广博士介绍说:环状RNA的蛋白翻译主要是通过内部核糖体进入位点(IRES)来实现其翻译过程的。与线性RNA IRES相比,环状RNA IRES含有更高的GC含量、更低的最小自由能,并且通常结构更为合理。然而,目前的IRES预测方法是针对线性mRNA设计的。换句话说,线性RNA中有活性的IRES在环状RNA中不一定可用。因此,迫切需要发展环状RNA IRES预测、评估以及相应的改造的方法,使得环状RNA可以用于不同的场景,如抗肿瘤治疗,预防性以及治疗性疫苗开发,遗传病治疗等等。奥明生物以及浙江大学智能创新药物研究院开发的DeepCIP是目前全球第一个专门为circRNA IRES预测开发的工具,也是目前全球第一个使用深度学习方法识别IRES序列的工具。

奥明(杭州)生物医药有限公司致力于环状mRNA药物研发,运用基因组学信息设计mRNA药物以满足临床上无法被传统药物满足的需求。奥明生物依托公司团队已构建的环状RNA可编程药物的数字化平台,与浙江大学智能创新药物研究院和中国计量大学共建有两个联合实验室,并与国内外多个大学的教授博士团队进行长期研发合作。目前,中国计量大学联合实验室承担了国家市场监督管理总局的科技计划项目《体外合成环状RNA的质量要求》,为快速发展的环状RNA市场设立计量标准。

浙江大学智能创新药物研究院由两院院士、国家杰青等领军人才领衔,组合一批博士、硕士作为核心骨干,构建覆盖人工智能新药研发主要领域的创新团队,重点发展基于创新靶点和原创理论的新药创制,着力打造创新药物智能设计、合成、筛选评价以及智能制造一体化创新药物核心研发体系,有效解决生物医药产业发展“卡脖子”问题,缩短原创新药研发周期、提高研发成功率,提升我国生物医药产业的核心竞争力。